Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A1BGP04217 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A1BGP04217 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
A1BGP04217 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A1BGP04217 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A1BGP04217 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A1BGP04217 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
A1BGP04217 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
A1BGP04217 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
A1BGP04217 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A1BGP04217 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A1BGP04217 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A1BGP04217 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
A1BGP04217 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
A1BGP04217 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A1BGP04217 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A1BGP04217 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A1BGP04217 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A1BGP04217 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
A1BGP04217 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
A1BGP04217 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms