Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DRAP01903 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DRAP01903 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms