Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHDP01880 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHDP01880 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHDP01880 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHDP01880 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHDP01880 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHDP01880 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHDP01880 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHDP01880 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHDP01880 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHDP01880 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHDP01880 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHDP01880 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHDP01880 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHDP01880 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHDP01880 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHDP01880 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHDP01880 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHDP01880 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHDP01880 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms