Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHA1P01876 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHA1P01876 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHA1P01876 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHA1P01876 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGHA1P01876 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHA1P01876 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHA1P01876 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms