Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IGHG1P01857 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHG1P01857 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms