Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01737 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01737 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01737 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01737 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01737 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01737 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01737 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01737 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01737 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01737 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01737 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01737 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01737 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01737 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01737 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01737 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms