Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASS1P00966 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASS1P00966 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASS1P00966 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASS1P00966 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASS1P00966 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASS1P00966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASS1P00966 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASS1P00966 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASS1P00966 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASS1P00966 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASS1P00966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASS1P00966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASS1P00966 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASS1P00966 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASS1P00966 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASS1P00966 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASS1P00966 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms