Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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TSPAN13O95857 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN13O95857 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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TSPAN13O95857 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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TSPAN13O95857 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TSPAN13O95857 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TSPAN13O95857 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPAN13O95857 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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TSPAN13O95857 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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