Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP4O95707 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POP4O95707 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POP4O95707 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POP4O95707 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POP4O95707 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POP4O95707 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POP4O95707 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POP4O95707 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POP4O95707 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP4O95707 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP4O95707 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP4O95707 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POP4O95707 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POP4O95707 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POP4O95707 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POP4O95707 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POP4O95707 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms