Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD1O95696 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD1O95696 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD1O95696 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD1O95696 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD1O95696 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD1O95696 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD1O95696 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD1O95696 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
BRD1O95696 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD1O95696 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD1O95696 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD1O95696 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD1O95696 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD1O95696 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD1O95696 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD1O95696 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD1O95696 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms