Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF1O95521 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF1O95521 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms