Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC24BO95487 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC24BO95487 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms