Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCB11O95342 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB11O95342 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms