Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD4O95243 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD4O95243 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD4O95243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD4O95243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD4O95243 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD4O95243 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD4O95243 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD4O95243 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD4O95243 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD4O95243 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD4O95243 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD4O95243 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD4O95243 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD4O95243 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD4O95243 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD4O95243 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD4O95243 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD4O95243 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD4O95243 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD4O95243 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms