Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAMP5O95183 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAMP5O95183 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP5O95183 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP5O95183 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP5O95183 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP5O95183 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP5O95183 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms