Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE4BO95155 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE4BO95155 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE4BO95155 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms