Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN1O94985 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN1O94985 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms