Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG2O94898 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRIG2O94898 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms