Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP1O94782 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP1O94782 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP1O94782 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP1O94782 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP1O94782 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP1O94782 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP1O94782 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP1O94782 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP1O94782 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP1O94782 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP1O94782 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP1O94782 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP1O94782 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP1O94782 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP1O94782 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP1O94782 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP1O94782 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP1O94782 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP1O94782 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP1O94782 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP1O94782 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms