Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT38O76015 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT38O76015 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT38O76015 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT38O76015 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT38O76015 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT38O76015 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT38O76015 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT38O76015 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT38O76015 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms