Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM1O75626 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms