Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN11O75508 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN11O75508 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms