Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F6O75461 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F6O75461 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F6O75461 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F6O75461 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F6O75461 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F6O75461 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms