Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDC45O75419 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDC45O75419 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDC45O75419 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDC45O75419 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDC45O75419 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDC45O75419 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDC45O75419 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDC45O75419 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC45O75419 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC45O75419 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDC45O75419 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms