Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH16O75309 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH16O75309 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH16O75309 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH16O75309 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH16O75309 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH16O75309 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH16O75309 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH16O75309 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms