Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM24O75264 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM24O75264 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM24O75264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms