Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX11AO75192 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11AO75192 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11AO75192 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11AO75192 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11AO75192 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX11AO75192 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms