Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED4O75132 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED4O75132 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms