Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL41O60662 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL41O60662 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms