Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLR5O60602 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLR5O60602 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR5O60602 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR5O60602 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLR5O60602 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR5O60602 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR5O60602 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLR5O60602 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLR5O60602 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLR5O60602 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR5O60602 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TLR5O60602 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR5O60602 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms