Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCNT1O60563 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNT1O60563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNT1O60563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms