Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSL4O60488 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSL4O60488 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms