Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN3BO60391 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIN3BO60391 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms