Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL13O43927 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL13O43927 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL13O43927 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms