Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRICKLE3O43900 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms