Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC25A20O43772 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC25A20O43772 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms