Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX6O43752 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX6O43752 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX6O43752 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX6O43752 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX6O43752 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX6O43752 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX6O43752 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX6O43752 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX6O43752 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX6O43752 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX6O43752 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX6O43752 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX6O43752 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX6O43752 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX6O43752 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX6O43752 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX6O43752 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX6O43752 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
STX6O43752 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX6O43752 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX6O43752 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX6O43752 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX6O43752 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX6O43752 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms