Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3O43617 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC3O43617 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms