Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DENRO43583 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DENRO43583 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DENRO43583 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DENRO43583 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DENRO43583 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DENRO43583 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DENRO43583 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DENRO43583 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DENRO43583 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
DENRO43583 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DENRO43583 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DENRO43583 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms