Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TBX1O43435 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TBX1O43435 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TBX1O43435 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TBX1O43435 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TBX1O43435 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TBX1O43435 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms