Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COCHO43405 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COCHO43405 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COCHO43405 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COCHO43405 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COCHO43405 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COCHO43405 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COCHO43405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COCHO43405 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COCHO43405 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COCHO43405 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COCHO43405 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COCHO43405 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COCHO43405 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COCHO43405 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms