Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SRGAP3O43295 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP3O43295 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms