Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SART1O43290 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SART1O43290 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SART1O43290 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SART1O43290 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SART1O43290 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SART1O43290 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SART1O43290 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SART1O43290 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SART1O43290 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SART1O43290 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SART1O43290 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SART1O43290 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SART1O43290 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SART1O43290 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SART1O43290 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SART1O43290 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SART1O43290 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms