Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRODHO43272 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRODHO43272 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PRODHO43272 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRODHO43272 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRODHO43272 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRODHO43272 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRODHO43272 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRODHO43272 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRODHO43272 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRODHO43272 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRODHO43272 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms