Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KDM6AO15550 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM6AO15550 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms