Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD3EAPO15446 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD3EAPO15446 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms