Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHUKO15111 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHUKO15111 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHUKO15111 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHUKO15111 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHUKO15111 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHUKO15111 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHUKO15111 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHUKO15111 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHUKO15111 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHUKO15111 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHUKO15111 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHUKO15111 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHUKO15111 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHUKO15111 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms