Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNMO15061 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNMO15061 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNMO15061 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNMO15061 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SYNMO15061 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNMO15061 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNMO15061 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNMO15061 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNMO15061 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNMO15061 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNMO15061 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNMO15061 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNMO15061 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNMO15061 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNMO15061 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNMO15061 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNMO15061 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNMO15061 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYNMO15061 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNMO15061 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SYNMO15061 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SYNMO15061 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNMO15061 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNMO15061 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYNMO15061 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYNMO15061 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYNMO15061 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SYNMO15061 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYNMO15061 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms