Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCKDKO14874 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BCKDKO14874 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCKDKO14874 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BCKDKO14874 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms