Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA3O00505 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA3O00505 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms